Ο Γιάννης Θωμαϊδης είναι απόφοιτος του Τμήματος Επιστήμης Φυσικής Αγωγής και Αθλητισμού Θεσσαλονίκης και κάτοχος διπλώματος UEFA PRO», αναφέρεται στην ανακοίνωση του ΠΑΣ.
Εκτός από τον Παναθηναϊκό, ο Θωμαΐδης έχει υπηρετήσει αρκετές ακόμα ομάδες ως ποδοσφαιριστής. Πιο συγκεκριμένα, έχει αγωνιστεί σε Δόξα Δράμας, ΟΦΗ, Απόλλωνα Αθηνών, Βέροια, Εθνικό Αστέρα, Πανηλειακό, Αναγέννηση Άρτας, Καστοριά, ΠΑΟΝΕ, Μακεδονικό Νεαπόλεως και Αετό Σκύδρας.
Έχε πτυχίο ο άνθρωπος όπως ο Χριστόπουλος,όχι μαλακίες,μας φλόμωσαν μ τον Νικοπολίδη